これらの核燃料物質は,加工事業所間においては,二酸化ウラン粉末又は六フッ化ウラン,また,加工事業所と原子力発電所等の間においては,新燃料集合体の形で輸送されている。
使用済燃料については,東海再処理工場で再処理する場合は,各原子力発電所から,専用運搬船により東海再処理工場へ輸送されている。
また,英国及びフランスに再処理を委託しているため,両国へも各原子力発電所から専用運搬船により輸送されている。
低レベル放射性廃棄物については,専用運搬船により全国の原子力発電所から六ケ所村の低レベル廃棄物埋設施設への輸送が行われている。
英国及びフランスでの再処理により回収されたプルトニウムについては,我が国に返還輸送し核燃料として使用することとしており,高速増殖炉原型炉「もんじゅ」の取替燃料製造に使用する約1.1トンのプルトニウム(核分裂性)のフランスから日本への海上輸送が,輸送船「あかつき丸」により1992年秋から1993年初めにかけて安全かつ確実に実施された。
また,同じく英国及びフランスでの再処理により発生する高レベル放射性廃棄物の我が国への返還については,フランスからの初回輸送が1995年2月から4月にかけて英国の輸送船「パシフィック・ピンテール号」によって行われ,輸送容器に納められたガラス固化体28本が返還された。なお,同船のむつ小川原港への入港に当たり,青森県知事が国及び事業者に対し青森県を高レベル放射性廃棄物の最終処分地にしないことについて改めて文書による回答を求めたため,その過程において「パシフィック・ピンテール号」の入港が1日遅れた。
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